「Dr.チョコレート」は、シンガポールで活動する外科医チーム「チョコレート・カンパニー」を描いたドラマで、主人公の唯（Dr.チョコレート）が10歳の少女として、高難度の手術を成功させるために患者を救う物語です。手術には1億円の現金、秘密保持契約、そしてチョコレートが必要で、物語は唯とカンパニーが患者である政治家の手術を通じて2年前の陰謀の真相に迫る様子を描いています。
一方で、唯は学校に通いたいという願望を持ち、友達との交流を望んでいます。物語は医療ドラマと復讐劇の要素を組み合わせ、唯の過去や友情、成長も描いています。また、アイドル活動や芸人のエピソードも絡み、登場人物たちの多様な一面が描かれています。
ドラマは次第に複雑な展開を迎え、患者の手術を通じて事件の真相が次第に明らかにされていきます。唯の過去やTeacherの心の闇も浮かび上がり、最終的には大きな陰謀が明らかになります。物語は感動の結末を迎え、主人公たちが新たな一歩を踏み出す姿が描かれます。